Das Profil eine Schule spiegelt sich in den Auszeichnungen wider, die eine Schule für ein langjährige Aktivitäten in einem bestimmten Bereich erhält.
MINT-EC-Schule
Im November 2015 wurde das Jakob-Fugger-Gymnasium aufgrund seines hervorragenden MINT Profils auf der MINT-EC Schulleitertagung am Friedrich-Koenig Gymnasium in Würzburg in das nationale Excellence Netzwerk von Schulen MINT-ECals Anwärterschule aufgenommen. Zwei Jahre später, im November 2017, wurde das Jakob-Fugger-Gymnasium als einzige Schule im Raum Augsburg als Mitglied in das Netzwerk der MINT-EC-Schulen aufgenommen den und ist damit eine von aktuell 59 bayerischen MINT-EC-Schulen. MINT-EC ist das nationale Excellence-Netzwerk von Schulen mit Sekundarstufe II und ausgeprägtem Profil in Mathematik, Informatik, Naturwissenschaften und Technik (MINT). MINT-EC bietet ein breites Veranstaltungs- und Förderangebot für Schülerinnen und Schüler sowie Fortbildungen und fachlichen Austausch für Lehrkräfte und Schulleitungen. Das Netzwerk mit derzeit 323 zertifizierten Schulen steht seit 2009 unter der Schirmherrschaft der Kultusministerkonferenz der Länder (KMK). Das Jakob-Fugger-Gymnasium ist die einzige Ausgabestelle für das von der Kultusministerkonferenz anerkannte MINT-EC Zertifikat.