Als eines von nur zwei Gymnasien in Augsburg, verfügt das Jakob Fugger Gymnasium über eine Akkreditierung der Kultusministerkonferenz (KMK), die mindestens bis zum Jahr 2027 gültig ist und ist daher in der Lage Projekte auf europäischer Ebene für Schülerinnen und Schüler, sowie Lehrkräfte umzusetzen.